জাতীয় মানবাধিকার কমিশনের সদস্যদের পদত্যাগের পর নতুন আইনি কাঠামো ও সংসদে পাস হওয়া সংশোধনী ঘিরে গভীর উদ্বেগ প্রকাশ করেছেন বিদায়ী চেয়ারম্যান বিচারপতি মইনুল ইসলাম চৌধুরীসহ কমিশনাররা। খোলা চিঠিতে তারা বিষয়টি তিনটি অংশে তুলে ধরেন—সংসদে উপস্থাপিত তথ্যের জবাব, সরকারের প্রকৃত আপত্তি চিহ্নিতকরণ এবং ভবিষ্যৎ আইনের মান নির্ধারণ। সংসদে উপস্থাপিত তথ্যের জবাব চিঠিতে বলা হয়, সংসদে গুমের সাজা, তদন্তের সময়সীমা ও জরিমানা সংক্রান্ত বিষয়ে ভুল ব্যাখ্যা দেওয়া হয়েছে। তাদের দাবি, বিদ্যমান অধ্যাদেশে সর্বোচ্চ শাস্তি মৃত্যুদণ্ডসহ কঠোর বিধান রয়েছে এবং তদন্ত ও জরিমানা আদায়ের স্পষ্ট কাঠামো নির্ধারিত ছিল, যা পুনর্বহালকৃত ২০০৯ সালের আইনে অনুপস্থিত। আইনগত কাঠামো ও আইসিটির প্রসঙ্গ চিঠিতে আরও বলা হয়, আন্তর্জাতিক অপরাধ ট্রাইব্যুনাল আইন (আইসিটি) কেবল মানবতাবিরোধী অপরাধে প্রযোজ্য, বিচ্ছিন্ন ফৌজদারি গুমের ক্ষেত্রে নয়। ফলে নতুন করে গুম সংক্রান্ত প্রতিকার সীমিত হয়ে পড়তে পারে বলে তারা আশঙ্কা প্রকাশ করেন। জুলাই সংশ্লিষ্ট সুরক্ষা ও তদন্ত ক্ষমতা কমিশনের মতে, নতুন কাঠামোতে মানবাধিকার কমিশনের তদন্ত ক্ষমতা বিশেষ করে নিরাপত্তা বাহিনীর বিরুদ্ধে অভিযোগ তদন্তের ক্ষেত্রে সীমিত করা হয়েছে, যা ভুক্তভোগীদের সুরক্ষায় নেতিবাচক প্রভাব ফেলতে পারে। সরকারের আপত্তি প্রসঙ্গে চিঠিতে বলা হয়, সরকার কমিশনের স্বাধীনতা সীমিত করার চেষ্টা করছে বলে তারা মনে করেন। বিশেষ করে কমিশনকে মন্ত্রণালয়ের অধীন করা, নিরাপত্তা বাহিনীর তদন্তে পূর্বানুমতির শর্ত এবং বাছাই কমিটিতে নির্বাহী প্রভাব বাড়ানোর বিষয়গুলো তারা উল্লেখ করেন। ভবিষ্যৎ আইনের মান নির্ধারণ বিদায়ী কমিশনাররা বলেন, নতুন আইন প্রণয়নে অংশীজনদের পরামর্শ থাকলেও, পূর্বের দুর্বল আইন পুনর্বহাল না করে আরও শক্তিশালী ও কার্যকর মানবাধিকার সুরক্ষা কাঠামো গঠন করা প্রয়োজন ছিল। একইসঙ্গে গুমকে ফৌজদারি অপরাধ হিসেবে আন্তর্জাতিক বাধ্যবাধকতা অনুযায়ী স্পষ্টভাবে সংজ্ঞায়িত করার ওপর জোর দেন তারা।